Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Taf4E9QAP7 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Taf4E9QAP7 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Taf4E9QAP7 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Taf4E9QAP7 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Taf4E9QAP7 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Taf4E9QAP7 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Taf4E9QAP7 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Taf4E9QAP7 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Taf4E9QAP7 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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