Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 M1ap-201ENSMUST00000113980 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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