Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Ptpn7-201ENSMUST00000049449 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccdc183A2AJB1 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccdc183A2AJB1 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccdc183A2AJB1 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccdc183A2AJB1 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Prdx6-202ENSMUST00000071718 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Ccdc183A2AJB1 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc183A2AJB1 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccdc183A2AJB1 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccdc183A2AJB1 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccdc183A2AJB1 9530026P05Rik-201ENSMUST00000181121 2142 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccdc183A2AJB1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc183A2AJB1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc183A2AJB1 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccdc183A2AJB1 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccdc183A2AJB1 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc183A2AJB1 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc183A2AJB1 Osbpl1a-204ENSMUST00000119043 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc183A2AJB1 Odf2-205ENSMUST00000113757 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc183A2AJB1 Fgd4-204ENSMUST00000161188 2214 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc183A2AJB1 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc183A2AJB1 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccdc183A2AJB1 Plscr2-205ENSMUST00000180154 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc183A2AJB1 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc183A2AJB1 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc183A2AJB1 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc183A2AJB1 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc183A2AJB1 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc183A2AJB1 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc183A2AJB1 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc183A2AJB1 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc183A2AJB1 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc183A2AJB1 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc183A2AJB1 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc183A2AJB1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc183A2AJB1 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc183A2AJB1 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc183A2AJB1 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc183A2AJB1 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc183A2AJB1 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ccdc183A2AJB1 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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