Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms