Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Plbd1-201ENSMUST00000032336 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 3110001I22Rik-201ENSMUST00000035426 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Ube2q1-202ENSMUST00000196726 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Spaca3-201ENSMUST00000103222 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm15727-201ENSMUST00000122416 437 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm28309-201ENSMUST00000136302 623 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Naa38-204ENSMUST00000144531 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm7138-201ENSMUST00000167669 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 2410141K09Rik-204ENSMUST00000173583 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Igkv4-54-201ENSMUST00000177697 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm8907-201ENSMUST00000182240 1003 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm44920-201ENSMUST00000206503 746 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm34105-201ENSMUST00000214812 571 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm43305-202ENSMUST00000225083 705 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 BC048562-201ENSMUST00000057265 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Tmbim7-201ENSMUST00000014673 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Ptgr2-201ENSMUST00000123614 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Cyp2b13-201ENSMUST00000005669 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Prss23-204ENSMUST00000207932 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm23129-201ENSMUST00000104259 132 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm15602-201ENSMUST00000116162 465 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm13861-201ENSMUST00000137136 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm25426-201ENSMUST00000157606 170 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Ctdp1-203ENSMUST00000161003 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm5259-201ENSMUST00000191231 800 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm45225-201ENSMUST00000206852 1139 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm44936-201ENSMUST00000207324 735 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Cryab-206ENSMUST00000217475 1117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 AC155293.1-201ENSMUST00000219793 1026 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Zfp389-202ENSMUST00000224437 1234 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 AC163351.1-201ENSMUST00000225539 737 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 2310016D03Rik-201ENSMUST00000190206 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm14705-201ENSMUST00000154109 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Olfr62-201ENSMUST00000102666 949 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Ighv2-2-201ENSMUST00000103443 352 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm15351-202ENSMUST00000150686 271 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm20924-201ENSMUST00000177663 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm20816-201ENSMUST00000177765 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm20909-201ENSMUST00000178234 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm20825-202ENSMUST00000178396 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm20852-201ENSMUST00000178761 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm20867-201ENSMUST00000178900 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21443-201ENSMUST00000179070 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm20747-201ENSMUST00000179137 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21394-201ENSMUST00000179523 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21783-201ENSMUST00000179570 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21812-201ENSMUST00000179590 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21721-201ENSMUST00000179595 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm20809-201ENSMUST00000179663 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm21118-201ENSMUST00000180179 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm20806-201ENSMUST00000180324 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm20909-202ENSMUST00000181205 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms