Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 AC153512.3-201ENSMUST00000220426 662 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pop5Q9DB28 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms