Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 201.9 ms