Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cntnap4Q99P47 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cntnap4Q99P47 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms