Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Ubxn4Q8VCH8 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
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Ubxn4Q8VCH8 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms