Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms