Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms