Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Tdp1-207ENSMUST00000153627 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 5330439K02Rik-201ENSMUST00000180953 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Pex5l-204ENSMUST00000108224 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Lpin3-201ENSMUST00000040872 3458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Mmgt1-201ENSMUST00000059899 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Phka2-204ENSMUST00000112380 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Dpy19l2-201ENSMUST00000133010 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Npas4-201ENSMUST00000056129 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm10634-202ENSMUST00000188891 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm28138-201ENSMUST00000186250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm29270-201ENSMUST00000188071 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm29392-201ENSMUST00000189429 2167 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm29252-201ENSMUST00000189869 2167 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm29305-201ENSMUST00000191054 2167 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Fam83c-201ENSMUST00000029143 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Eif3c-201ENSMUST00000032992 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Ufl1-202ENSMUST00000102994 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Ccdc50Q810U5 Synj2-207ENSMUST00000115788 3498 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Ccdc50Q810U5 Ophn1-202ENSMUST00000113826 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Mid1-204ENSMUST00000112104 3860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Baiap3-201ENSMUST00000169109 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Pik3c3-202ENSMUST00000115811 3084 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Rbm10-204ENSMUST00000115374 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Slc25a44-201ENSMUST00000057935 3577 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Mrpl47-201ENSMUST00000043966 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Galnt1-201ENSMUST00000000430 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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