Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

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Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Dsg1bQ7TSF1 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Dsg1bQ7TSF1 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Dsg1bQ7TSF1 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Dsg1bQ7TSF1 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Dsg1bQ7TSF1 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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