Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms