Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Usp49Q6P9L4 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp49Q6P9L4 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp49Q6P9L4 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Usp49Q6P9L4 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp49Q6P9L4 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Usp49Q6P9L4 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Usp49Q6P9L4 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Usp49Q6P9L4 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Usp49Q6P9L4 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp49Q6P9L4 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp49Q6P9L4 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp49Q6P9L4 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Usp49Q6P9L4 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Usp49Q6P9L4 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp49Q6P9L4 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Usp49Q6P9L4 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Usp49Q6P9L4 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Usp49Q6P9L4 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp49Q6P9L4 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp49Q6P9L4 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usp49Q6P9L4 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Usp49Q6P9L4 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp49Q6P9L4 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Usp49Q6P9L4 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp49Q6P9L4 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp49Q6P9L4 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp49Q6P9L4 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp49Q6P9L4 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp49Q6P9L4 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp49Q6P9L4 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp49Q6P9L4 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Usp49Q6P9L4 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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