Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm6721-201ENSMUST00000218353 1445 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm436-201ENSMUST00000105747 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Rhox4a-201ENSMUST00000115194 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm15664-201ENSMUST00000160167 184 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm35299-201ENSMUST00000195865 421 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm46189-201ENSMUST00000219395 644 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm6378-201ENSMUST00000084199 444 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 AC134898.1-201ENSMUST00000223738 1836 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Anapc15-203ENSMUST00000098237 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Crygf-202ENSMUST00000114027 594 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm13303-201ENSMUST00000117125 1284 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm6500-201ENSMUST00000119412 451 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 4933424L21Rik-201ENSMUST00000142486 1186 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm44139-201ENSMUST00000204903 373 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Sparc-208ENSMUST00000214685 1269 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 BC048562-201ENSMUST00000057265 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Fdps-201ENSMUST00000081848 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm2492-201ENSMUST00000221355 1394 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm33466-201ENSMUST00000199819 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm45895-201ENSMUST00000212248 1697 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Rpl7a-ps12-201ENSMUST00000120384 794 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm26594-201ENSMUST00000180383 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 4933436E23Rik-201ENSMUST00000192824 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm42952-204ENSMUST00000198572 408 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm44709-201ENSMUST00000207649 448 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Rps4l-ps-201ENSMUST00000059737 768 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Gm8083-201ENSMUST00000203976 475 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 AC140426.1-201ENSMUST00000227933 459 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Katnal2-211ENSMUST00000154665 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc18Q640L5 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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