Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bhlha9Q5RJB0 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms