Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Traf3ip1Q149C2 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms