Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm35299-201ENSMUST00000195865 421 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm44460-201ENSMUST00000196179 129 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm31374-201ENSMUST00000213885 619 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm10053-201ENSMUST00000073080 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Speer2-201ENSMUST00000076500 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm45895-201ENSMUST00000212248 1697 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm23129-201ENSMUST00000104259 132 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm13781-201ENSMUST00000124153 492 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 1700028K03Rik-202ENSMUST00000159902 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Actb-207ENSMUST00000167721 1242 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Ly6c1-206ENSMUST00000188845 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 B130024G19Rik-204ENSMUST00000191084 634 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm18646-201ENSMUST00000212240 1063 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm4883-201ENSMUST00000085702 528 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Slc7a9-203ENSMUST00000118969 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 1700010K24Rik-201ENSMUST00000125852 226 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Fam47e-205ENSMUST00000175974 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm3898-201ENSMUST00000180221 613 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm7815-201ENSMUST00000196104 832 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm38246-201ENSMUST00000194318 1511 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Ttc23-203ENSMUST00000107471 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Fcrla-203ENSMUST00000159171 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 A630023P12Rik-203ENSMUST00000141532 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 1700026D11Rik-205ENSMUST00000151417 789 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Mir6396-201ENSMUST00000183603 111 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 4930458K08Rik-201ENSMUST00000219952 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm18621-201ENSMUST00000222677 679 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm26205-201ENSMUST00000082907 134 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Pax5-202ENSMUST00000102932 1460 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm31763-202ENSMUST00000218205 1724 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Fut8-202ENSMUST00000171770 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Vgll3-202ENSMUST00000227997 1383 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Gm22661-201ENSMUST00000104192 132 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Rsl24d1-203ENSMUST00000165177 597 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Tead1-211ENSMUST00000170352 1218 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top2aQ01320 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms