Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Mir669a-7-201ENSMUST00000180364 87 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Wfdc12-201ENSMUST00000051272 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Grin2cQ01098 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms