Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Pde1bQ01065 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Pde1bQ01065 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Pde1bQ01065 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Pde1bQ01065 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Pde1bQ01065 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pde1bQ01065 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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