Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gjb2Q00977 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms