Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RhodP97348 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RhodP97348 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms