Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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SbdsP70122 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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SbdsP70122 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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