Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm42836-201ENSMUST00000197198 728 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Gm35135-201ENSMUST00000219885 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LtbrP50284 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms