Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Acbd5-212ENSMUST00000227663 4566 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Tardbp-202ENSMUST00000084125 7477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm37759-201ENSMUST00000194155 3246 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Trim69-201ENSMUST00000036089 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Daam1-201ENSMUST00000085299 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm26809-201ENSMUST00000180863 2981 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Tm4sf1-201ENSMUST00000029376 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Ldlr-201ENSMUST00000034713 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Nbr1-203ENSMUST00000103099 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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