Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Glrb-206ENSMUST00000194085 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ptk2P34152 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ptk2P34152 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ptk2P34152 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm45299-202ENSMUST00000211011 765 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Lrtm1-203ENSMUST00000224760 3060 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ptk2P34152 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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