Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxrgP28705 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms