Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RxraP28700 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
RxraP28700 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RxraP28700 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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