Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 AC115784.1-201ENSMUST00000227687 1010 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Clec12b-202ENSMUST00000112082 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd8P23463 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms