Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P20040 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P20040 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P20040 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P20040 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P20040 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P20040 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P20040 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P20040 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P20040 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P20040 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P20040 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
P20040 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P20040 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P20040 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P20040 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P20040 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P20040 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P20040 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P20040 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P20040 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P20040 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P20040 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P20040 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms