Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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TtrP07309 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TtrP07309 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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