Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms