Protein–RNA interactions for Protein: P01654

Ig kappa chain V-III region PC 2880/PC 1229, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01654 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01654 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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P01654 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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P01654 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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P01654 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01654 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01654 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01654 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01654 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01654 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01654 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01654 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01654 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms