Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ssxb8B1AY40 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ssxb8B1AY40 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ssxb8B1AY40 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ssxb8B1AY40 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ssxb8B1AY40 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ssxb8B1AY40 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Ssxb8B1AY40 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Ssxb8B1AY40 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Ssxb8B1AY40 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Ssxb8B1AY40 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Ssxb8B1AY40 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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