Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Atp8b5A3FIN4 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Atp8b5A3FIN4 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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Atp8b5A3FIN4 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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Atp8b5A3FIN4 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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