Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 4930455D15Rik-201ENSMUST00000181632 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Nos2-203ENSMUST00000214397 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm13527-201ENSMUST00000117926 691 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm14654-201ENSMUST00000118620 447 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm12362-201ENSMUST00000121986 342 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm11493-201ENSMUST00000134567 566 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm8203-201ENSMUST00000173192 387 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm43122-202ENSMUST00000202259 526 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 AC156633.1-201ENSMUST00000215971 614 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Olfr1115-201ENSMUST00000081986 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Fcgr3-204ENSMUST00000169017 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 AC132833.1-202ENSMUST00000228875 1690 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Mcph1-205ENSMUST00000146819 2067 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm15535-202ENSMUST00000148478 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm8914-201ENSMUST00000101396 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm5071-201ENSMUST00000104922 1035 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm15720-201ENSMUST00000117133 282 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm5400-201ENSMUST00000118494 943 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm12240-201ENSMUST00000120178 229 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Plxna4os3-201ENSMUST00000127668 269 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm12415-201ENSMUST00000141637 512 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Mpv17-204ENSMUST00000200864 878 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 AC163646.3-201ENSMUST00000228879 772 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 1700013G24Rik-201ENSMUST00000048893 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm5072-201ENSMUST00000063726 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Slc51b-201ENSMUST00000065894 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r40-201ENSMUST00000171942 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r44-203ENSMUST00000226120 1772 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Col5a3Q9JLI2 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm436-201ENSMUST00000105747 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm14834-201ENSMUST00000119416 795 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Rpl7a-ps13-201ENSMUST00000121692 563 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Actg2-202ENSMUST00000121731 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gemin7-205ENSMUST00000122127 652 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm14108-201ENSMUST00000122234 494 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Hnf1aos1-202ENSMUST00000129609 516 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm16131-201ENSMUST00000131007 659 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm16013-201ENSMUST00000152249 353 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm16574-201ENSMUST00000159301 745 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 AC107851.1-201ENSMUST00000215982 417 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 AC129590.1-201ENSMUST00000225573 852 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Prpf39-201ENSMUST00000120580 4069 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms