Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tlr5Q9JLF7 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tlr5Q9JLF7 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Tlr5Q9JLF7 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tlr5Q9JLF7 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms