Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RhojQ9ER71 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RhojQ9ER71 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RhojQ9ER71 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RhojQ9ER71 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RhojQ9ER71 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RhojQ9ER71 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RhojQ9ER71 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
RhojQ9ER71 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RhojQ9ER71 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RhojQ9ER71 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
RhojQ9ER71 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RhojQ9ER71 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RhojQ9ER71 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RhojQ9ER71 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RhojQ9ER71 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RhojQ9ER71 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RhojQ9ER71 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RhojQ9ER71 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
RhojQ9ER71 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhojQ9ER71 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms