Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Parp10-201ENSMUST00000075689 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Tm4sf1-201ENSMUST00000029376 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Fam53b-206ENSMUST00000106168 3630 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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