Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB85

Rrp8, Ribosomal RNA-processing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp8Q9DB85 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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