Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cldn22Q9D7U6 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cldn22Q9D7U6 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cldn22Q9D7U6 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cldn22Q9D7U6 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Cldn22Q9D7U6 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Cldn22Q9D7U6 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Cldn22Q9D7U6 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Cldn22Q9D7U6 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Cldn22Q9D7U6 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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