Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Khdc3Q9CWU5 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Khdc3Q9CWU5 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms