Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rdm1Q9CQK3 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms