Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Use1Q9CQ56 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Use1Q9CQ56 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Use1Q9CQ56 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Use1Q9CQ56 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Use1Q9CQ56 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Use1Q9CQ56 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Use1Q9CQ56 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Use1Q9CQ56 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Use1Q9CQ56 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Use1Q9CQ56 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Use1Q9CQ56 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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Use1Q9CQ56 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms