Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Atg3Q9CPX6 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Atg3Q9CPX6 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Atg3Q9CPX6 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Atg3Q9CPX6 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Atg3Q9CPX6 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Atg3Q9CPX6 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Atg3Q9CPX6 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg3Q9CPX6 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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