Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Bhlhe41Q99PV5 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms