Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Gm7823-201ENSMUST00000120761 1623 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Gm9-201ENSMUST00000101636 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Gm16193-201ENSMUST00000125903 778 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 4930538E20Rik-201ENSMUST00000131383 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Maats1os-201ENSMUST00000133496 326 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Mir6360-201ENSMUST00000184278 126 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Gm10344-201ENSMUST00000193498 1419 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 AC161877.1-201ENSMUST00000227736 699 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Casp14-201ENSMUST00000005488 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Gm4880-201ENSMUST00000207645 1696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rims1Q99NE5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Ighv8-6-201ENSMUST00000103524 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 S100a16-205ENSMUST00000107334 879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rims1Q99NE5 Rplp1-ps1-201ENSMUST00000119410 345 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rims1Q99NE5 Gm16574-201ENSMUST00000159301 745 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Gm6773-201ENSMUST00000182377 878 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Gm27241-201ENSMUST00000183517 622 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Xlr4b-201ENSMUST00000069077 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Tstd2-202ENSMUST00000107772 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Gm10406-201ENSMUST00000100895 1813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rims1Q99NE5 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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