Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Fadd-201ENSMUST00000033394 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Bub1b-201ENSMUST00000038341 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Usp27Q8CEG8 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 9130221F21Rik-201ENSMUST00000206867 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Parp3-201ENSMUST00000067218 2962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm7932-202ENSMUST00000205047 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Fam217a-202ENSMUST00000223834 2253 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Cd22-213ENSMUST00000190617 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Slc13a4-201ENSMUST00000031868 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Atg9a-201ENSMUST00000040689 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Slc18a2-201ENSMUST00000026084 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Usp27Q8CEG8 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Limk1-202ENSMUST00000111233 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Usp27Q8CEG8 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Usp27Q8CEG8 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Usp27Q8CEG8 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Usp27Q8CEG8 Myadm-201ENSMUST00000096744 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Elavl1-204ENSMUST00000209010 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 AC122293.1-201ENSMUST00000218333 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Olfr287-204ENSMUST00000170618 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Npnt-205ENSMUST00000117456 3383 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Capn3-202ENSMUST00000028749 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Qars-201ENSMUST00000006838 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp27Q8CEG8 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms