Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pramef8Q8CE24 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pramef8Q8CE24 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms